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數(shù)字切片掃描系統(tǒng)

發(fā)布時間:2018-04-12人氣:1298

數(shù)字掃描切片系統(tǒng)是一種用于生物學、農(nóng)學領域的分析儀

1、Easyscan 6



Easyscan 6
產(chǎn)品簡介
EasyScan是麥克奧迪自主研發(fā)設計的數(shù)字切片掃描與應用系統(tǒng),利用一體化全自動顯微鏡掃描平臺,結(jié)合虛擬切片軟件系統(tǒng),對傳統(tǒng)玻璃切片進行掃描、無縫拼接生成一張全視野的數(shù)字化切片。EasyScan通過MOTIC 專用軟件與網(wǎng)絡系統(tǒng),進行切片的掃描、存儲、管理、觀察、分析、討論等,相較于傳統(tǒng)方式,不受空間與時間限制,可應用于組織胚胎學、病理學、微生物學、動植物學、寄生蟲學、醫(yī)學等眾多領域。EasyScan數(shù)字系列目前有1片和6片兩種型號,其中,Easyscan6一次支持裝載6張切片進行掃描,適用于對掃描數(shù)量要求不高的中小型科研及醫(yī)療等相關(guān)機構(gòu)。

規(guī)格說明

型號

Easyscan 6

物鏡

平場復消色差20X/0.75,10X/0.3

掃描時間

標準模式: 160s (40X模式)、標準模式: 60s(20X模式)

對焦技術(shù)

實時自動對焦

掃描模式

標準(實時自動對焦)、高精度(高精度自動對焦)、EDF(景深擴展)、
Z-層疊(Z方向多層掃描)

成像系統(tǒng)

3攝像頭成像系統(tǒng)

掃描攝像頭


500萬像素(2/3英寸高速芯片)

分辨率

20X模式下,分辨率為0.48pm/pixel,允差為5%
40X模式下,分辨率為0.24pm/pixel,允差為5%

物鏡轉(zhuǎn)換器

3孔

光源

10W LED(壽命: 25,000小時)

切片容量

6片

切片尺寸

76X26mm,切片尺寸公差長: +0/-1mm,寬: +0/-1mm

標配軟件

EasyScanner、DSAssistant(可選DSServer)


2、EasyScan NFC 300

EasyScan NFC 300
產(chǎn)品簡介
EasyScan系列數(shù)字切片掃描與應用系統(tǒng),利用一體化全自動顯微鏡掃描平臺,將傳統(tǒng)玻璃切片進行掃描、無縫拼接生成一張全視野的數(shù)字化切片,不受空間與時間限制,可應用于組織胚胎學、病理學、微生物學、動植物學、寄生蟲學、醫(yī)學等眾多領域。

EasyScan NFC系列掃描儀將NFC(近場通信技術(shù))與數(shù)字切片掃描與應用系統(tǒng)相結(jié)合,通過一體化全自動顯微鏡掃描平臺,生成一張全視野的數(shù)字化切片,利用NFC,可快速定位問題切片,節(jié)省人工檢查時間。該系統(tǒng)可自動識別聚焦錯誤、厚薄不均、切片放反等問題切片,可用于常規(guī)切片以及冰凍切片的掃描、瀏覽、儲存、傳輸。EasyScan NFC系列目前有60片、102片、300片三種型號,EasyScan NFC 300一次支持裝載300張切片進行掃描,適合對掃描數(shù)量有很高需求的大型科研及醫(yī)療等相關(guān)機構(gòu)。


規(guī)格說明

型號

EasyScan NFC 300

物鏡

平場復消色差20X/0.75,10X/0.3

掃描時間

標準模式: 100s (40X模式)、標準模式: 50s (20x模式)

對焦技術(shù)

實時自動對焦

圖像質(zhì)量控制

NFC智能檢測

掃描模式

標準(實時自動對焦)、高精度(高精度自動對焦)、EDF(景深擴展)、
Z-層疊(Z方向多層掃描)

成像系統(tǒng)

3攝像頭成像系統(tǒng)

掃描攝像頭


1200萬像素(2/3英寸高速芯片)

分辨率

20X模式下,分辨率為0.48pm/pixel,允差為5%
40X模式下,分辨率為0.24pm/pixel,允差為5%

物鏡轉(zhuǎn)換器

3孔

光源

10W LED(壽命: 25,000小時)

切片容量

300片

切片尺寸

76X26mm,切片尺寸公差長: +0/-1mm,寬: +0/-1mm

標配軟件

EasyScanner、DSAssistant Plus(可選DSE)



3、EasyScan NFC 102



EasyScan NFC 102
產(chǎn)品簡介
EasyScan NFC系列掃描儀將NFC(近場通信技術(shù))與數(shù)字切片掃描與應用系統(tǒng)相結(jié)合,通過一體化全自動顯微鏡掃描平臺,生成一張全視野的數(shù)字化切片,利用NFC,可快速定位問題切片,節(jié)省人工檢查時間。該系統(tǒng)可自動識別聚焦錯誤、厚薄不均、切片放反等問題切片,可用于常規(guī)切片以及冰凍切片的掃描、瀏覽、儲存、傳輸。EasyScan NFC系列目前有60片、102片、300片三種型號,EasyScan NFC 102一次支持裝載102張切片進行掃描,適合對掃描數(shù)量有著更高要求的科研及醫(yī)療等相關(guān)機構(gòu)。

規(guī)格說明

型號

EasyScan NFC 102

物鏡

平場復消色差20X/0.75,10X/0.3

掃描時間

標準模式: 100s (40X模式)、標準模式: 50s (20x模式)

對焦技術(shù)

實時自動對焦

圖像質(zhì)量控制

NFC智能檢測

掃描模式

標準(實時自動對焦)、高精度(高精度自動對焦)、EDF(景深擴展)、
Z-層疊(Z方向多層掃描)

成像系統(tǒng)

3攝像頭成像系統(tǒng)

掃描攝像頭


1200萬像素(2/3英寸高速芯片)

分辨率

20X模式下,分辨率為0.48pm/pixel,允差為5%
40X模式下,分辨率為0.24pm/pixel,允差為5%

物鏡轉(zhuǎn)換器

3孔

光源

10W LED(壽命: 25,000小時)

切片容量

102片

切片尺寸

76X26mm,切片尺寸公差長: +0/-1mm,寬: +0/-1mm

標配軟件

EasyScanner、DSAssistant Plus(可選DSE)

4、EasyScan NFC 60



EasyScan NFC 60
產(chǎn)品簡介
EasyScan NFC系列掃描儀將NFC(近場通信技術(shù))與數(shù)字切片掃描與應用系統(tǒng)相結(jié)合,通過一體化全自動顯微鏡掃描平臺,生成一張全視野的數(shù)字化切片,利用NFC,可快速定位問題切片,節(jié)省人工檢查時間。該系統(tǒng)可自動識別聚焦錯誤、厚薄不均、切片放反等問題切片,可用于常規(guī)切片以及冰凍切片的掃描、瀏覽、儲存、傳輸。EasyScan NFC系列目前有60片、102片、300片三種型號,EasyScan NFC 60一次支持裝載60張切片進行掃描,能夠滿足主流科研及醫(yī)療等相關(guān)機構(gòu)對于掃描數(shù)量的要求。

規(guī)格說明

型號

EasyScan NFC 60

物鏡

平場復消色差20X/0.75,10X/0.3

掃描時間

標準模式: 100s (40X模式)、標準模式: 50s (20x模式)

對焦技術(shù)

實時自動對焦

圖像質(zhì)量控制

NFC智能檢測

掃描模式

標準(實時自動對焦)、高精度(高精度自動對焦)、EDF(景深擴展)、
Z-層疊(Z方向多層掃描)

成像系統(tǒng)

3攝像頭成像系統(tǒng)

掃描攝像頭


1200萬像素(2/3英寸高速芯片)

分辨率

20X模式下,分辨率為0.48pm/pixel,允差為5%
40X模式下,分辨率為0.24pm/pixel,允差為5%

物鏡轉(zhuǎn)換器

3孔

光源

10W LED(壽命: 25,000小時)

切片容量

60片

切片尺寸

76X26mm,切片尺寸公差長: +0/-1mm,寬: +0/-1mm

標配軟件

EasyScanner、DSAssistant Plus(可選DSE)

5、EasyScan 1



EasyScan 1
產(chǎn)品簡介
EasyScan是麥克奧迪自主研發(fā)設計的數(shù)字切片掃描與應用系統(tǒng),利用一體化全自動顯微鏡掃描平臺,結(jié)合虛擬切片軟件系統(tǒng),對傳統(tǒng)玻璃切片進行掃描、無縫拼接生成一張全視野的數(shù)字化切片。EasyScan通過MOTIC 專用軟件與網(wǎng)絡系統(tǒng),進行切片的掃描、存儲、管理、觀察、分析、討論等,相較于傳統(tǒng)方式,不受空間與時間限制,可應用于組織胚胎學、病理學、微生物學、動植物學、寄生蟲學、醫(yī)學等眾多領域。EasyScan數(shù)字系列目前有1片和6片兩種型號,其中,Easyscan1一次支持裝載1張切片,適用于對掃描數(shù)量要求不高的中小型科研及醫(yī)療等相關(guān)機構(gòu)。

規(guī)格說明

型號

Easyscan 1

物鏡

平場復消色差20X/0.75,10X/0.3

掃描時間

標準模式: 160s (40X模式)、標準模式: 60s(20X模式)

對焦技術(shù)

實時自動對焦

掃描模式

標準(實時自動對焦)、高精度(高精度自動對焦)、EDF(景深擴展)、
Z-層疊(Z方向多層掃描)

成像系統(tǒng)

3攝像頭成像系統(tǒng)

掃描攝像頭


500萬像素(2/3英寸高速芯片)

分辨率

20X模式下,分辨率為0.48pm/pixel,允差為5%
40X模式下,分辨率為0.24pm/pixel,允差為5%

物鏡轉(zhuǎn)換器

3孔

光源

10W LED(壽命: 25,000小時)

切片容量

1片

切片尺寸

76X26mm,切片尺寸公差長: +0/-1mm,寬: +0/-1mm

標配軟件

EasyScanner、DSAssistant(可選DSServer)

作為專業(yè)的顯微成像整體方案設計者,我們可以完全按照用戶的使用需求設計理想的成像方案。

全自動數(shù)字切片掃描系統(tǒng)介紹:

數(shù)字切片掃描儀是一種集光學、機械、電子、計算機等多學科技術(shù)為一體的精密儀器,通過控制顯微成像系統(tǒng)和切片以一定的規(guī)則運動,采集多張連續(xù)的高分辨率顯微圖像,再無縫拼接生成一張高分辨率的全切片圖像(WSI,也稱為虛擬切片)。傳統(tǒng)切片變成一張高分辨率的數(shù)字圖片后,用戶可以脫離顯微鏡隨時隨地在計算機或移動設備上瀏覽切片,這種數(shù)字圖片具有永不褪色,易于保存、管理、分享以及可隨意放大縮小全方位觀看等優(yōu)點,已經(jīng)廣泛應用于病理診斷、教學培訓、藥物研究和科學研究等領域。隨著應用的拓展,促使切片掃描儀技術(shù)的不斷進步,出現(xiàn)了多種掃描技術(shù),顯著提高了掃描速度,完成掃描時間已從最早的幾十分鐘縮短到現(xiàn)有的幾十秒。這些技術(shù)包括走停模式的面陣掃描、連續(xù)運動的線陣掃描、連續(xù)運動的面陣掃描、連續(xù)運動的微物鏡陣列掃描,主要區(qū)別在于所用的圖像傳感器和切片運動方式兩方面,圖像傳感器主要有面陣和線陣兩種,切片運動方式主要有走停和連續(xù)運動兩種。

   1走停模式的面陣掃描

   基于走停模式面陣掃描的數(shù)字切片掃描儀主要由電動載物臺、顯微成像系統(tǒng)和面陣圖像傳感器組成。工作時首先將切片沿著其Y方向劃分成若干個連續(xù)的等間距掃描條帶,每個掃描條帶的寬度為顯微成像系統(tǒng)的物方視場在Y方向的尺寸,相鄰條帶間留有一定的重疊部分,同時將每個掃描條帶沿著X方向再劃分成若干個連續(xù)的掃描視場,每個掃描視場的長度為成像系統(tǒng)的物方視場在X方向的尺寸,相鄰掃描視場間留有一定的重疊部分,如圖1所示;然后控制載物臺帶動切片從第一條掃描條帶的第一個掃描視場開始,以掃描視場為單位進行走走停停的步進,依次穿過顯微成像系統(tǒng),載物臺每次停止后,面陣圖像傳感器開始對焦并曝光采集圖像,直到當前條帶的所有掃描視場采集完成;再后根據(jù)相鄰視場的重疊區(qū)域拼接成一個條帶,并沿Y方向移動至下一個掃描條帶掃描,依此類推,采集完所有條帶的圖像;最后根據(jù)相鄰條帶的重疊區(qū)域進行無縫拼接,生成一張完整的數(shù)字切片圖。

   最早的產(chǎn)品是Bacus實驗室(后被奧林巴斯收購)于1994年研發(fā)的BLISS系統(tǒng),該系統(tǒng)是在顯微鏡上改進而成的。該系統(tǒng)的實現(xiàn)方法較為簡單,但采集過程中要求載物臺走走停停,而且停止后還需再等待一段時間,確保載物臺穩(wěn)定后再開始對焦和曝光,因而速度非常慢。其中對焦過程比較費時間,需要在Z方向采集多張圖像以計算出離焦量,然后再驅(qū)動至焦面。通常一個視場對焦一般需要若干秒時間,15 mm×15 mm的掃描范圍一般需要1 000個視場,再加上載物臺移動及等待時間,圖像采集及拼接時間,需要幾十分鐘。此掃描速度比較慢,主要問題在于對焦方法上,后續(xù)出現(xiàn)了兩種改進方案:一是采用焦面建模的方法,即先選取切片的若干視場并以計算出的焦面位置作為模型點,根據(jù)這幾個模型點再通過算法估算出切片中每個視場的焦面位置,這樣在掃描時,只需根據(jù)建模的焦面位置直接對焦即可,如DigiPath的PathScope在20×模式時,15 mm×15 mm的掃描范圍可以縮短到150 s左右,由于此方法大部分視場的焦面是由建模估算而得,不能確保每個掃描視場是完全清晰的;二是采用專用的自動對焦裝置,每個掃描視場的對焦時間縮短到幾十毫秒左右,麥克奧迪實業(yè)集團有限公司的最新產(chǎn)品EasyScan就集成了專用自動對焦裝置,能有效提高掃描速度,在40×分辨率時,最快可以達到160 s(掃描范圍15 mm×15 mm),同時能確保每個掃描視場準確對焦。

   2連續(xù)運動的線陣掃描(簡稱線掃)

   該方案借用了遙感領域和工業(yè)檢測領域中成熟的線陣圖像傳感器掃描技術(shù),主要由電動載物臺、顯微成像系統(tǒng)和線陣圖像傳感器組成。工作時首先將切片沿著其Y方向劃分成若干個連續(xù)的等間距掃描條帶,每個掃描條帶的寬度為顯微成像系統(tǒng)的物方視場在Y方向的尺寸,相鄰條帶間留有一定的重疊部分,如圖2所示;然后根據(jù)上述提到的焦面建模方法計算出切片的焦面模型,控制載物臺帶動切片從第一條掃描條帶開始,以一定的速度勻速運動,同時控制線陣圖像傳感器按一定時序同步曝光,實現(xiàn)對當前條帶的圖像采集,直到當前條帶采集完成,再移動至下一個掃描條帶掃描成像,依此類推,采集完所有條帶的圖像;最后根據(jù)相鄰條帶的重疊區(qū)域進行無縫拼接成一張數(shù)字切片。

   該方法在對每個條帶進行掃描成像時,載物臺帶動切片是連續(xù)運動的,不需要走走停停和等待,也不需要拼接,所以速度比較快。線掃的數(shù)字切片掃描儀最早是Aperio(2021年被Leica收購)于2021年推出的,隨后Leica、Hamamatsu、江豐等也相繼推出。目前速度最快的是Hamamatsu的NanoZoomerXR,在40×模式下掃描15 mm×15 mm范圍只需45 s。該產(chǎn)品采用的是一種更為高級的線陣圖像傳感器即時間延遲積分(TDI)傳感器,其操作與線陣圖像傳感器類似,不同之處在于TDI圖像傳感器擁有幾十甚至上百條線陣。工作時,每條線陣圖像傳感器分時對同一標本曝光,然后再疊加,圖3為4級TDI傳感器的工作原理圖,經(jīng)過4級疊加后,圖像信號大大增強,因而等效的曝光時間可以更短,切片可以以更高的速度同步運動,也就是掃描速度更快。

   采用線掃方式速度較快,但其對載物臺的控制要求較高,線陣傳感器的成本也比較高。另外,由于采用建模方法對焦,容易出現(xiàn)掃描模糊的問題。

   3連續(xù)運動的面陣掃描

   此方法綜合了上述兩種技術(shù)的特點:其組成跟技術(shù)1一樣,采用的是面陣圖像傳感器,工作時也需事先按照技術(shù)1的方法將切片在X和Y方向劃分成若干個連續(xù)的掃描視場,如圖4所示;掃描方法則跟技術(shù)2一樣,具體為控制載物臺帶動切片在X方向上進行連續(xù)運動并穿過顯微成像系統(tǒng),每移動一個掃描視場時,面陣圖像傳感器同步高速曝光和采集圖像,直到當前條帶的所有視場采集完成,然后根據(jù)相鄰掃描視場的重疊區(qū)域拼接成一個條帶,再移到下一條帶掃描,依此類推,采集完所有條帶的圖像,最后根據(jù)相鄰條帶的重疊區(qū)域拼接成一張數(shù)字切片。該方案主要是在技術(shù)1基礎上改進軟件,使得面陣傳感器的曝光時序與載物臺移動速度匹配,實現(xiàn)較為簡單,且由于沒有技術(shù)1的走走停停,掃描速度可以提高很多,因而同時具有線掃速度快和成本較低的優(yōu)點。典型的廠家有Motic、Zeiss、3D Histech等,其中3D Histech最新一代的數(shù)字切片掃描儀Pannoramic FlashⅢ在40×模式下,掃描15 mm×15 mm的范圍可以達到60 s以內(nèi),與線掃技術(shù)的速度相當。

   4微物鏡陣列掃描

   一般數(shù)字切片掃描使用的標準物鏡20×/0.75,

   其物方視場一般為1.1 mm左右,考慮到平場性,實際視場一般最多也只用到1 mm。所以掃描15 mm×15 mm時,至少要掃描15個條帶,這在一定程度上限制了掃描速度。該技術(shù)采用一種微物鏡陣列和定制的圖像傳感器來提高掃描視場,以減少掃描條帶,從而提高掃描速度。所采用的微物鏡陣列共有80個微物鏡組成,每個微物鏡的視場是250 μm,按照一定的規(guī)律排列,確保每個微物鏡的視場在掃描方向上的投影構(gòu)成一條連續(xù)的線段,通過圖像處理可合并成一個線視場為20 mm線陣掃描系統(tǒng),如圖5所示。這樣掃描15 mm×15 mm只需掃描一個條帶即可,速度非常快。此技術(shù)由美國DMetrix公司于2021年推出,18 mm×50 mm的范圍只需158 s就可以掃描完成,此掃描速度在當時是非常快的。

   該技術(shù)需要先拼接成一個大視場的線陣成像系統(tǒng),且由于掃描視場大,其對焦方式也非常有挑戰(zhàn)性,比線掃技術(shù)更為復雜。另外關(guān)鍵器件如微透鏡陣列和圖像傳感器都是定制的,成本高,通用性不強。

   5結(jié)論

   從上述的幾種數(shù)字切片掃描技術(shù)原理及其特點來看:微物鏡陣列掃描具有速度快,但實現(xiàn)復雜,成本高;線掃可以實現(xiàn)較快的速度,但隨著連續(xù)運動的面陣掃描技術(shù)的發(fā)展,其速度優(yōu)勢也不明顯,且對控制要求也較高,也容易出現(xiàn)掃描模糊問題;基于面陣傳感器掃描實現(xiàn)較為簡單,可工作于連續(xù)運動和走停兩種模式,連續(xù)掃描運動模式可以提供與線掃接近的掃描速度,走停模式可以提高掃描成功率并獲得更好的圖像質(zhì)量。



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